Плодовитость имеет большое хозяйственное значение. Плодовитость кобылы — число жеребят, полученных от нее за всю ее жизнь, плодовитость жеребца — процент зажеребляемости нормальных в половом отношении кобыл, слученных с ним. Конечно, эти показатели только наиболее достоверные, но далеко не точные, так как плодовитость животных зависит от очень многих биологических и хозяйственных факторов. Так, например, при косячной случке кобыл, как правило, жеребцы и кобылы оказываются более плодовитыми, чем при ручной; применение системы случки с контролем созревания фолликула дает более высокий процент зажеребляемости, чем при случке с ориентацией только на внешние признаки охоты; по мере старения лошадей бесспорно снижается их плодовитость (это относится как к кобылам, так и к жеребцам); наличие наследственных задатков, которые вызывают смерть зародыша, снижает показатели плодовитости. Недостаток в рационе маток и жеребцов некоторых микроэлементов (особенно меди) и витаминов (особенно А и Е) снижает зажеребляемость, и, наоборот, на сбалансированных рационах по микроэлементам и витаминам процент зажеребляемости повышается.

Однако все же плодовитость, как и другие хозяйственно полезные признаки, обусловлена наследственностью, и отбор по плодовитости дает положительный эффект.

В настоящее время выявлены наследственные факторы, обусловливающие пониженную плодовитость или полную ее потерю:

а) дефект оболочки головки сперматозоида, при котором спермий не может пробить защитную оболочку яйцеклетки. Полагают, что этот наследственный дефект вызывается действием одного рецессивного задатка и проявляется только в гомозиготном состоянии;

б) эксцентрическое прикрепление жгутика сперматозоида. Предполагается, что такая форма бесплодия обусловлена аутосомным наследственным задатком в гомозиготном состоянии;

в) врожденная аномалия половых желез — гипоплазия (недоразвитие). Бывает от очень слабой до полной, главным образом встречается левосторонняя. Предполагается, что этот дефект обусловлен одним рецессивным геном, проявляющимся в гомозиготном состоянии;

г) крипторхизм (задержка обычно неразвитых семенников в брюшной полости) встречается довольно часто у лошадей всех пород. Односторонние крипторхи способны давать потомство, но зажеребляемость от них пониженная. Двухсторонние — бесплодны. Крипторхи очень неудобны в условиях хозяйственного использования, так как их невозможно кастрировать и в то же время они ведут себя как полноценные жеребцы. Предположение, что крипторхизм обусловлен одним доминантным геном, не согласуется с фактами, известными в рысистом и чистокровном коннозаводстве, когда крипторхи не дали ни одного потомка с этим пороком;

д) гермафродитизм. У лошадей встречается редко, характер наследования этого порока не изучен. В коннозаводской литературе много раз писали о двойнях у лошадей. Общее мнение селекционеров сводится к тому, что этот признак нежелателен, так как он сопровождается большим количеством выкидышей (50—55%). Роды двойнями бывают трудными и часто кончаются для кобыл летальным исходом. Смертность среди двойневых жеребят очень высокая. Способность давать двойни ненаследственна, и нет никакой необходимости обращать внимание на то, имеются ли в родословной данного животного кобылы, дававшие двойни. Не-обосновано и утверждение некоторых коневодов о том, что способность кобыл давать двойни коррелирует с таким полезным качеством лошадей, как дистанционность.